Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc33Q3ULW6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms