Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULF4

Spg7, Paraplegin, mousemouse

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg7Q3ULF4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spg7Q3ULF4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spg7Q3ULF4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms