Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E330014E10RikQ3UL33 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms