Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ell2Q3UKU1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ell2Q3UKU1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms