Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3UJP5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3UJP5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3UJP5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3UJP5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3UJP5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UJP5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UJP5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UJP5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UJP5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3UJP5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3UJP5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q3UJP5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms