Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp19Q3UJD6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp19Q3UJD6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms