Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sf3b2Q3UJB0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms