Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms