Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH06

Rreb1, Ras-responsive element-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rreb1Q3UH06 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rreb1Q3UH06 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rreb1Q3UH06 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rreb1Q3UH06 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rreb1Q3UH06 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rreb1Q3UH06 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rreb1Q3UH06 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rreb1Q3UH06 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rreb1Q3UH06 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rreb1Q3UH06 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rreb1Q3UH06 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rreb1Q3UH06 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rreb1Q3UH06 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rreb1Q3UH06 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rreb1Q3UH06 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rreb1Q3UH06 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rreb1Q3UH06 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rreb1Q3UH06 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rreb1Q3UH06 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rreb1Q3UH06 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rreb1Q3UH06 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rreb1Q3UH06 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rreb1Q3UH06 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rreb1Q3UH06 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rreb1Q3UH06 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rreb1Q3UH06 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rreb1Q3UH06 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rreb1Q3UH06 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rreb1Q3UH06 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rreb1Q3UH06 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rreb1Q3UH06 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rreb1Q3UH06 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rreb1Q3UH06 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rreb1Q3UH06 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rreb1Q3UH06 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rreb1Q3UH06 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rreb1Q3UH06 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rreb1Q3UH06 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rreb1Q3UH06 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rreb1Q3UH06 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms