Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Carmil3Q3UFQ8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Carmil3Q3UFQ8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Carmil3Q3UFQ8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Carmil3Q3UFQ8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms