Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Puf60Q3UEB3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms