Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttll12Q3UDE2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms