Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp8Q3UD82 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp8Q3UD82 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms