Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp6Q3U6U5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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