Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hectd3Q3U487 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms