Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf149Q3U2C5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms