Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tatdn3Q3U1C6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tatdn3Q3U1C6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms