Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
InipQ3TXT3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
InipQ3TXT3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
InipQ3TXT3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
InipQ3TXT3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
InipQ3TXT3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
InipQ3TXT3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
InipQ3TXT3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
InipQ3TXT3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
InipQ3TXT3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
InipQ3TXT3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
InipQ3TXT3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
InipQ3TXT3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
InipQ3TXT3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
InipQ3TXT3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
InipQ3TXT3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
InipQ3TXT3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
InipQ3TXT3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
InipQ3TXT3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms