Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc28Q3TX51 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc28Q3TX51 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms