Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTL0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3TTL0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTL0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3TTL0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3TTL0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3TTL0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3TTL0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTL0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms