Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdnep1Q3TP92 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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