Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cwc27Q3TKY6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cwc27Q3TKY6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cwc27Q3TKY6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cwc27Q3TKY6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cwc27Q3TKY6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cwc27Q3TKY6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cwc27Q3TKY6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cwc27Q3TKY6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cwc27Q3TKY6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cwc27Q3TKY6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cwc27Q3TKY6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms