Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RubcnlQ3TD16 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms