Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr27Q3SYJ2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms