Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Riiad1Q3KNY5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms