Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vax1Q2NKI2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms