Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrna5Q2MKA5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna5Q2MKA5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms