Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sap25Q1EHW4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms