Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tdrd9Q14BI7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tdrd9Q14BI7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tdrd9Q14BI7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tdrd9Q14BI7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tdrd9Q14BI7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tdrd9Q14BI7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tdrd9Q14BI7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tdrd9Q14BI7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tdrd9Q14BI7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tdrd9Q14BI7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tdrd9Q14BI7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tdrd9Q14BI7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms