Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Gli2Q0VGT2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Gli2Q0VGT2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gli2Q0VGT2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms