Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppp4r2Q0VGB7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppp4r2Q0VGB7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppp4r2Q0VGB7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppp4r2Q0VGB7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp4r2Q0VGB7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms