Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc162pQ0VG85 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc162pQ0VG85 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms