Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb8Q0VBD0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms