Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Kndc1Q0KK55 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kndc1Q0KK55 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms