Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ttc21bQ0HA38 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttc21bQ0HA38 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms