Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssrp1Q08943 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssrp1Q08943 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms