Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp2Q08652 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms