Protein–RNA interactions for Protein: Q08288

Lyar, Cell growth-regulating nucleolar protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LyarQ08288 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LyarQ08288 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LyarQ08288 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LyarQ08288 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LyarQ08288 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LyarQ08288 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LyarQ08288 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LyarQ08288 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LyarQ08288 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LyarQ08288 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LyarQ08288 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LyarQ08288 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LyarQ08288 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LyarQ08288 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LyarQ08288 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LyarQ08288 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LyarQ08288 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LyarQ08288 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LyarQ08288 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LyarQ08288 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LyarQ08288 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LyarQ08288 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LyarQ08288 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LyarQ08288 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LyarQ08288 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LyarQ08288 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LyarQ08288 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LyarQ08288 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LyarQ08288 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LyarQ08288 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LyarQ08288 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LyarQ08288 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LyarQ08288 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LyarQ08288 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LyarQ08288 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LyarQ08288 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LyarQ08288 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LyarQ08288 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LyarQ08288 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LyarQ08288 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LyarQ08288 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LyarQ08288 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LyarQ08288 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LyarQ08288 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LyarQ08288 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LyarQ08288 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LyarQ08288 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LyarQ08288 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LyarQ08288 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LyarQ08288 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LyarQ08288 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LyarQ08288 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LyarQ08288 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms