Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CbfbQ08024 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CbfbQ08024 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms