Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Col9a2Q07643 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a2Q07643 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms