Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nfe2Q07279 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nfe2Q07279 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms