Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf3Q07104 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdf3Q07104 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms