Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox4Q06831 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms