Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp2Q06649 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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