Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrx2Q06348 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx2Q06348 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms