Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnal1Q05A62 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms