Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mex3cQ05A36 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mex3cQ05A36 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mex3cQ05A36 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mex3cQ05A36 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mex3cQ05A36 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mex3cQ05A36 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mex3cQ05A36 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mex3cQ05A36 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mex3cQ05A36 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mex3cQ05A36 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms