Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r236Q05A06 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms