Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprgQ05909 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprgQ05909 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms