Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RelbQ04863 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelbQ04863 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RelbQ04863 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelbQ04863 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelbQ04863 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelbQ04863 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms